Az alacsony szénhidráttartalmú étrend hosszú távú hatásaival kapcsolatos viták nem hallanak a tudományos közösségben. Ha figyelembe vesszük a gyors fogyást rövid idő alatt, akkor az ilyen étrend elég hatékony. Néhány tudós azonban kétségbe vonja az ilyen étrend tápértékét. A szakembereknek még nehéz megmondani, hogy milyen következményekkel járhat az étrend ilyen összetétele.
John Buckley, a dél-ausztráliai egyetem egészségügyi professzora meg van győződve arról, hogy mielőtt tanácsot adna egy adott étrenddel kapcsolatban, meg kell értenie egy ilyen választás következményeit. Az alacsony szénhidráttartalmú étrend tekintetében kijelenti: a szénhidrátbevitel csökkentése magasabb „rossz koleszterinszinthez” vezethet. Ezért a szív- és érrendszeri problémák.
El kell ismerni, hogy a "rossz koleszterin" szintje szerencsére egy idő után csökken. De az elveszített súly nem marad az elért szintnél. Általában a kilogrammok gyorsan növekednek.
Sokkal komolyabb a hangulattal kapcsolatos tartós problémák, például a depresszió lehetősége. Ezen felül, ha elutasítja a szénhidrátokat (és ezek forrása olyan hasznos növényi ételek, mint a teljes kiőrlésű gabonafélék, zöldségek és gyümölcsök), akkor az ember elveszíti a szükséges tápanyagokat és antioxidánsokat, amelyek jótékony hatással vannak a szívre és az erekre. A rost, a kalcium és a folsav szintén nem érhető el megfelelő mennyiségben.
